مع تزايد الكوارث سواء الطبيعية أو الحروب، يفقد الكثيرون مأواهم ومصادر عيشهم. وسرعان ما تهب الهيئة لإغاثة تلك المجتمعات المنكوبة من خلال توزيع المواد الغذائية الأساسية وتوفير المأوى والاحتياجات الصحية. وتنفذ الهيئة بعد مرحلة الإغاثة برامج توطين النازحين وإعادة الإعمار كما تقوم أيضاً:
- إقامة مخيمات اللاجئين وتقديم الخدمات الصحية والغذائية الفورية للمتضررين من جراء الكوارث.
- تزويد المناطق المنكوبة بالخيام، البطانيات، الأدوية والمستلزمات الطبية المختلفة.
- إرسال فرق المتطوعين المؤهلين لتنفيذ عمليات الإغاثة الميدانية في المناطق المنكوبة.
- إقامة مراكز علاج حالات سوء التغذية الحادة بين الأطفال في المناطق المصابة بالجفاف.